深圳疾病控制中心與華大基因合作,3日完成對該市首例、全球第5例H5N6流感病例的病毒基因測序。
2015年12月29日,深圳市報告一例H5N6流感病例。此后,深圳疾控中心對患者咽拭子樣本和活禽市場外環(huán)境樣本分離出的H5N6流感病毒進(jìn)行基因測序,2016年1月3日完成了全基因組序列分析。
測序結(jié)果顯示,患者樣本中H5N6病毒HA、NA基因與2014年廣東省從鴨只中分離的H5N6病毒高度同源,同源性大于98%;與深圳2014年活禽市場外環(huán)境分離出的H5N6病毒高度同源,同源性大于98%;與深圳2015年12月份來自外環(huán)境標(biāo)本分離出的三株H5N6病毒高度同源。
患者樣本中H5N6病毒HA、NA基因與2014年四川和廣東省報告的兩例H5N6流感病例的病毒高度同源,同源性大于98%。
患者樣本中H5N6病毒的內(nèi)部6個基因與本地外環(huán)境中H9N2病毒高度同源,H9N2病毒為該病毒的內(nèi)部骨架供體。
患者樣本中H5N6病毒HA和NA基因分別來源于外環(huán)境中的H5N1病毒和H6N6病毒。
深圳疾控中心專家認(rèn)為,從測序分析,目前深圳活禽市場外環(huán)境存在H5N6流感病毒,本次報告病例的病毒與活禽市場外環(huán)境的病毒高度同源,從生物信息學(xué)角度證實(shí)本次病例是因接觸活禽或市場外環(huán)境感染的。
專家表示,減少人與活禽密切接觸的機(jī)會,可有效預(yù)防人感染H5N6流感。其中一個重要的措施是切實(shí)推行活禽集中屠宰、冷鏈配送、生鮮上市。該措施在國際上被普遍認(rèn)可,發(fā)達(dá)國家在上世紀(jì)二三十年代就開始推廣禽類生鮮上市,目前,歐美、日本等發(fā)達(dá)國家以及港澳地區(qū)已實(shí)行生鮮禽類代替活禽上市。
該專家還表示,病毒的具體重配過程,還在深入研究中。
